高新技術企業認定中，主要風險集中在高新收入、知識產權、研發費用、科技人員這四個方面。

政策規定：高新技術產品(服務)收入指企業通過研發和相關技術創新活動，取得的產品（服務）收入與技術性收入的總和。對企業主要產品（服務）發揮核心支持作用的技術屬于《國家重點支持的高新技術領域》規定的范圍。
①高新技術領域
企業需正確選擇企業涉及的高新技術領域。例如涉及委托加工的企業，把商品委托加工后收回加價出售，就不屬于自身擁有的具備核心技術的高新收入。
②高新收入占同期總收入比值
總收入是指收入總額減去不征稅收入，如果企業其他收入較高，可能會使技術收入占比不達標，例如投資收益的增加需要關注。
③主要產品(服務)收入的占比
主要產品（服務）是指高新技術產品（服務）中，擁有在技術上發揮核心支持作用的知識產權的所有權，且收入之和在企業同期高新技術產品（服務）收入中超過50%的產品（服務）。

二、知識產權

政策規定：企業通過自主研發、受讓、受贈、并購等方式，獲得對其主要產品（服務）在技術上發揮核心支持作用的知識產權的所有權；對企業主要產品（服務）發揮核心支持作用的技術屬于《國家重點支持的高新技術領域》規定的范圍。

①知識產權與高新收入之間關系

知識產權需與主要產品(服務)密切相關，對相關收入具備支撐作用，即需準備科技成果轉化的外部證據。外部證據包括知識產權證書、成果鑒定證書、產品驗證報告、技術評估報告、合同文件等。科技成果轉化可以從新產品、新設備、新技術應用等方面進行展示，每種類型都應準備相應的證明材料。

②知識產權有效期

知識產品是否為本企業申報前三年的1月1日起至申報日前獲得。

③知識產權技術領域

知識產權的技術領域是否屬于《高新技術領域目錄》。

三、研發費用

政策規定：企業近三個會計年度的研究開發費用總額占同期銷售收入總額的比例符合要求。

①研發項目制度

是否建立完善的研發項目全流程管理制度。

②研發費用歸集

研發費用歸集范圍是否準確，與加計扣除口徑差異是否過大。

③研發費用會計核算

是否設立專用研究開發費用輔助核算科目和研發費用輔助帳。

④研發費用占銷售收入比例

近三個會計年度的研發費用總額占同期銷售收入總額的比例是否達標。

四、科技人員

政策規定：企業從事研發和相關技術創新活動的科技人員占企業當年職工總數的比例不低于10%，企業科技人員是指直接從事研發和相關技術創新活動，以及專門從事上述活動的管理和提供直接技術服務的人員，包括在職、兼職和臨時聘用人員。

①科技人員工作時間

查看是否簽訂勞動合同，合同簽訂日期，確認當年是否超過180天。

②研發人員工作內容

從研發人員名單中，抽取研發人員進行約談，包括詢問主要工作內容、工作時間等。檢查研發人員學歷、崗位說明判斷是否與研發活動相關。

③科技人員占職工總數比例

核查企業花名冊、勞動合同、個稅和社保證明等，確認職工總數和科技人員數量占比是否符合要求。